Relaciones filogenéticas del cerdo pelón de Yucatán con razas asiáticas y europeas mediante el ADN mitocondrial

• Clemente Lemus Postgraduate Program in Biological and Agricultural Sciences. Academic Unit of Veterinary Medicine and Zootechnics and Academic Unit of Agriculture, Autonomous University of Nayarit, México. https://orcid.org/0000-0002-5120-6805
• Gilberto Lemus Postgraduate Program in Biological and Agricultural Sciences. Academic Unit of Veterinary Medicine and Zootechnics and Academic Unit of Agriculture, Autonomous University of Nayarit, México. https://orcid.org/0000-0003-2451-1940
• Job Bugarín Postgraduate Program in Biological and Agricultural Sciences. Academic Unit of Veterinary Medicine and Zootechnics and Academic Unit of Agriculture, Autonomous University of Nayarit, México. https://orcid.org/0000-0001-6280-8281
• Rogelio Alonso Molecular Genetics Laboratory, Department of Genetics and Biostatistics. Faculty of Veterinary Medicine and Zootechnics, National Autonomous University of Mexico https://orcid.org/0000-0002-4159-1682
• Raúl Ulloa Molecular Genetics Laboratory, Department of Genetics and Biostatistics. Faculty of Veterinary Medicine and Zootechnics, National Autonomous University of Mexico https://orcid.org/0000-0002-6181-8346
• José Segura Campus of Biological and Agricultural Sciences, Autonomous University of Yucatán, Yucatán, México. https://orcid.org/0000-0003-1329-9948
• Miguel Ayala Department of Animal Production, University of Guadalajara, Mexico https://orcid.org/0000-0002-7535-2452
• Raúl Sansor Mexican Association of Iberian Pig Breeders, Yucatán, A.C., Mexico. https://orcid.org/0000-0001-9854-9445

Palabras clave: genética, PCR, razas locales, haplotipos, linaje

Resumen

En México existen genotipos de cerdos nativos cuyas poblaciones enfrentan serias amenazas para su supervivencia. Uno de ellos es el cerdo pelón de Yucatán (YUCMEX), para el cual se dispone de información limitada sobre su estado de conservación actual. Este estudio tuvo como objetivo determinar la relación filogenética de YUCMEX con cerdos ibéricos, jabalíes (WB), europeos, asiáticos y comerciales utilizando la región D-loop del ADNmt. Se analizaron un total de 31 secuencias de YUCMEX y 77 haplotipos mitocondriales de GenBank, alineados a la secuencia de referencia AJ002189. El fragmento de estudio, recortado entre las posiciones 15435 y 15977, resultó en 543 pares de bases. Se calcularon distancias genéticas para comparar YUCMEX con los otros grupos de cerdos. Los árboles filogenéticos se construyeron utilizando el método Neighbor-Joining con la distancia de dos parámetros de Kimura y 1000 réplicas bootstrap. Además, se realizó un análisis de componentes principales (ACP) basado en distancias evolutivas. Entre las 108 secuencias analizadas, se identificaron 41 sitios variables y 44 haplotipos. Los individuos YUCMEX se agruparon en cuatro haplogrupos (HA, HB, HC, HD), mostrando menor diversidad de bucle D y distancia genética con respecto a la raza Duroc. Los haplotipos europeos y asiáticos formaron siete grupos filogenéticos, separando claramente ambas regiones. Los haplogrupos YUCMEX se agruparon en tres linajes cercanos al WB de Portugal y España, pero distintos de los haplotipos WB de los cerdos asiáticos y de Europa del Este. Estos hallazgos confirman el origen europeo, específicamente ibérico, del cerdo pelón de Yucatán.

Citas

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